Het Multatuli Museum beschikt over een uitgebreid documentatiecentrum. Hierin bevinden zich meer dan 3.000 boeken, meer dan 1.000 brochures en ongeveer 10.000 artikelen in knipselvorm. De circa 5.000 manuscripten en meer dan 1.000 foto's, prenten en affiches, deels uit Multatuli's tijd, zijn opgenomen in het bruikleen van het Multatuli Genootschap bij de Universiteitsbibliotheek te Amsterdam. Bij Bijzondere Collecties aldaar is dit materiaal in te zien.

Bijna al dit materiaal is via de computer ontsloten. De eerste zeven delen van Multatuli's Volledige Werken zijn ook via de computer raadpleegbaar. Het is mogelijk op elk gewenst woord of begrip te zoeken. In dit programma zijn ook de Multatuli-encyclopedie en de Bijbel, veel gebruikt door Multatuli, opgenomen.

Multatuli-publicaties beschikbaar via internet

Het Geheugen van Nederland, Metamorfoze en het Multatuli Museum hebben de handen ineengeslagen. Sinds 4 november zijn 600 publicaties van en over Multatuli online te zien op www.geheugenvannederland.nl, de digitale schatkamer van het Nederlands verleden.
De documenten, in het bezit van het Multatuli Museum in Amsterdam, werden gedigitaliseerd met subsidie van Metamorfoze, het landelijke programma voor het behoud van het papieren erfgoed. Op www.geheugenvannederland.nl kunnen de gedigitaliseerde publicaties van kaft tot kaft worden doorgebladerd. Te zien zijn onder meer afleveringen uit Multatuli’s beroemde Ideën, en de schermutselingen op papier tussen de schrijver en zijn criticasters.